人型陶瓷雕像（秘鲁瓦里文化），公元500-1200

鸟纹纺织品（秘鲁钱凯文化），公元1200-1400

巴西考古部分收集了大量文物。这些文物由前殖民时期在巴西领土上繁荣的文化所产生，有超过90,000件物品。而这些来自巴西各地区的文物也组成一条超过1万年的文物时间表。自19世纪初以来，这些文物逐渐被聚集起来。1867年，人们开始系统地收集，并通过挖掘，收购和捐赠不断扩展至今。同时，此地也作为学术界人士，内里约热内卢联邦大学等机构进行研究项目的基地。

拟人陪葬瓮（Marajoara文化），公元400-1400

陶瓷器皿（“女象柱”花瓶），圣塔伦文化 ，公元1000-1400

历史沿革

巴西国家博物馆由葡萄牙国王若昂六世（1769-1826年）成立于1818年，命名为“皇家博物馆”，初衷为促进巴西的科学研究，在那之前是一个巨大的野生聚居地，几乎未经科学开发。最初的时候，博物馆里收藏了大量的动植物样本，尤其是鸟类的样本，因此被人们称之为“鸟之屋”。

在那之后，随着若昂六世的儿子、巴西第一位国王佩德罗一世（1798-1834年）与奥地利莱翁波迪亚公主结姻，博物馆开始吸引19世纪欧洲最伟大的博物学家。而其他探索了该国的欧洲研究者，如奥古斯丁·圣希莱尔（1799-1853年），也都贡献了藏品。

1870年的巴西国家博物馆

在19世纪末的时候，由于巴西国王佩德罗二世的个人偏好，博物馆开始涉足新的领域，包括人类学、古生物学和考古学。佩德罗二世本身也是一个业余科学家和科学所有分支科学的热烈拥护者，他也收藏了古埃及艺术和植物化石，由于佩德罗二世的努力，国家博物馆开始向现代化发展，成为南美自然历史和人类科学最重要的博物馆。

位于里约热内卢的巴西国家博物馆

当国王在1889年的军事政变中被废黜时，他仍是一个非常受欢迎的人物，所以共和党试图抹去帝国的象征。这些符号之一，即位于昆拉达博阿维斯塔的国王官邸圣克里斯托旺宫殿，成为空置；因而在1892年，国家博物馆及其所有的收藏品、贵重物品和研究人员都被转移到这座宫殿，在那里停留直到今天。

2018年，巴西国家博物馆则是举行了纪念其建立200周年的活动。