其中，国家博物馆的考古收藏品包括100,000多件物品，涵盖了自旧石器时代至19世纪以来生活在美洲、欧洲、非洲和中东的多个文明所产生的不同文化的重要文物。展馆内分为四个主要部分：古埃及、地中海文化、前哥伦比亚考古和巴西考古，而最后的巴西部分更是展馆的核心部分，自1867年以来，系统、全面地梳理了巴西卡布拉琳的历史，及保护了巴西考古学相关的最重要的材料记录。

Sha-amun-en-su的石棺及木乃伊，公元前750年

埃及木乃伊（“公主Kherima”），公元1至3世纪

古埃及部分收藏了700多件物，是拉丁美洲最大的，也是美洲最古老的考古学馆。 大部分物品由当时的商人Nicolau Fiengo从马赛带来了一批埃及文物，于1826年进入博物馆，成为其藏品。这些文物曾属于着名的意大利探险家Giovanni Battista Belzoni，他曾负责挖掘Theban Necropolis（现代） 卢克索）和卡纳克神庙。

Raia的石碑， 公元前1300 - 1200年

Hori的石棺， 公元前1049-1026

阿蒙的青铜雕像

地中海文化部分则收藏总计约750件馆藏，主要包括希腊，罗马，伊特鲁里亚和伊塔利奥特的文物。此前大部分作品都属于希腊罗马皇帝特雷莎·克里斯蒂娜（Teresa Cristina）的收藏品，她从小就对考古学感兴趣。 女皇于1843年来到里约热内卢，在她与皇帝佩德罗二世结婚后，她带来了赫库兰尼姆和庞贝城发掘过程中发现的文物。

科拉雕像，希腊文明，公元前5世纪

寺庙壁画，公元前1世纪

雪花石膏雕塑，希腊化时期

而前哥伦比亚考古部分则收藏了前哥伦比亚时代美洲土着人民生产的大约1,800件文物以及安第斯木乃伊。整个19世纪，该系列从巴西皇室的藏品中崛起，其中一些物品来自皇帝佩德罗二世的私人收藏，后来通过收购，捐赠，交流和挖掘扩大。在19世纪末，该系列藏品作为南美考古学最大的收藏品之一，已然引用了相当大的声望。